Pooja Toshniwal Paharia

Le niveau d’ARN SARS-CoV-2 circulant ou de protéine de pointe est-il associé à la gravité aiguë de la maladie ?

Dans une étude récente publiée dans le medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont étudié les niveaux de protéine de pointe (S) du coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère circulant et d’acide ribonucléique viral (ARN) chez les patients hospitalisés atteints d’une maladie à coronavirus aiguë 2019 (COVID -19) et chez les patients avec et sans séquelles post-aiguës de COVID-19 (PASC).

Étude : Présence persistante de la protéine Spike et de l'ARN viral dans la circulation des individus présentant des séquelles post-aiguës de COVID-19.  Crédit d'image : Yeti pointillé / Shutterstock
Étude : Présence persistante de la protéine Spike et de l’ARN viral dans la circulation des individus présentant des séquelles post-aiguës de COVID-19. Crédit d’image : Yeti pointillé / Shutterstock

Arrière plan

Des progrès considérables ont été réalisés dans la recherche liée aux manifestations aiguës de la COVID-19 ; cependant, les données PASC sont manquantes. Élucider les mécanismes sous-jacents de la physiopathologie du PASC est essentiel pour identifier les individus les plus susceptibles de développer le PASC et pour rechercher des cibles pour le développement de médicaments potentiels contre le SRAS-CoV-2.

À propos de l’étude

Dans la présente étude, les chercheurs ont recherché si le SRAS-CoV-2 S ou l’ARN circulant étaient associés à la gravité de la COVID-19 aiguë et si la persistance des composants viraux était corrélée aux manifestations PASC.

Les niveaux de SARS-CoV-2 S et d’ARN dans le plasma de 151 patients aigus atteints de COVID-19 (n = 116, symptomatiques et hospitalisés) ou PASC ont été analysés, et leur diagnostic de COVID-19 a été confirmé par réaction en chaîne. ) tests Les patients atteints de COVID-19 aigu ont été classés sur la base des scores de progression clinique / gravité de la maladie de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) comme (i) COVID-19 modéré sans oxygène (Odeux) besoins (n ​​= 39), (ii) COVID-19 modéré nécessitant une supplémentation en oxygène (n = 40) et (iii) COVID-19 sévère (n = 37).

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Les individus étaient considérés comme des patients PASC s’ils présentaient ≥ 1 symptôme de COVID-19 pendant > 8 semaines après le diagnostic de COVID-19. De plus, 12 patients du biodépôt COVID aigu ont été inclus dans l’analyse. Des échantillons du groupe COVID-19 aigu ont été obtenus le jour initial de l’inscription et tous les trois jours jusqu’à la sortie de l’hôpital ou le décès.

Les échantillons du groupe PASC ont été obtenus le jour du recrutement ≥ 18 semaines après la période aiguë de COVID-19. L’ARN du SRAS-CoV-2 extrait des échantillons a été évalué à l’aide d’analyses de PCR numérique par gouttelettes de transcription inverse (RT-ddPCR). De petites vésicules extracellulaires dérivées du plasma (SEV) ont été isolées et analysées, et les niveaux de SARS-CoV-2 S et SEV ont été mesurés par des dosages immuno-enzymatiques (ELISA).

Les données sur la démographie, les comorbidités, l’indice de masse corporelle (IMC), les symptômes du COVID-19 et la durée entre le dernier rapport positif sur le SRAS-CoV-2 et le recrutement de l’étude ont été obtenues à partir d’enquêtes REDCap et/ou de dossiers médicaux électroniques. Des enquêtes ont été menées au recrutement et tous les trois mois à l’aide du formulaire de déclaration de cas post-COVID de l’OMS (CRF post-COVID-19).

Résultats

Parmi les patients hospitalisés atteints d’infections aiguës par le SRAS-CoV-2, des corrélations positives ont été observées pour les dimères S et D du SRAS-CoV-2, la durée de l’hospitalisation, les scores maximaux de l’OMS et entre les niveaux d’ARN du SRAS-CoV-2. -2 et LDH (lactate déshydrogénase, taux de biomarqueurs de lésions tissulaires). La comparaison de 33 patients PASC présentant des symptômes post-COVID-19 (PASC positifs) et de 14 patients PASC négatifs a montré une probabilité plus élevée de présence du SRAS-CoV-2 et d’ARN viral chez les patients PASC (avec des niveaux considérablement plus élevés dans certains cas). ) par rapport aux patients atteints d’infections aiguës par le SRAS-COV-2.

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La positivité de l’ARN du SRAS-CoV-2 était plus élevée chez les patients PASC atteints d’infections aiguës par le SRAS-CoV-2, tandis que le SRAS-CoV-2 S était similaire entre les deux groupes. De plus, certaines protéines SARS-CoV-2 S étaient liées à des véhicules électriques sans ARN SARS-CoV-2 dans les vésicules. L’ARN du SRAS-CoV-2 a été trouvé chez 33 %, 35 % et 37 % des patients atteints de COVID-19 modéré sans besoin d’O2, de COVID-19 modéré avec besoin d’O2 et de COVID-19 sévère, respectivement, sans niveaux significativement différents de chacun d’eux. les groupes.

Les pourcentages correspondants pour les trois groupes pour la présence de SARS-CoV-2 S étaient de 51 %, 68 % et 68 %, respectivement. Environ 45 %, 37 % et 50 % des échantillons positifs au SARS-CoV-2 S des groupes correspondants ont montré le SARS-CoV-2 S dans les véhicules électriques. Les niveaux d’ARN du SRAS-CoV-2 étaient significativement corrélés aux valeurs d’IMC chez les patients atteints de COVID-19 sévère.

La positivité globale pour l’ARN et la protéine S du SRAS-CoV-2 était de 35 % et 62 %, respectivement, chez les patients COVID-19 présentant des symptômes aigus. Environ 34% et 6% des patients du groupe COVID-19 aigu ont été testés positifs pour le SRAS-CoV-2 S uniquement et l’ARN du SRAS-CoV-2 uniquement. Les symptômes du PASC étaient plus susceptibles de se développer chez les femmes présentant des comorbidités respiratoires telles que l’apnée obstructive du sommeil ou l’asthme.

Les patients PASC négatifs étaient plus susceptibles de souffrir de diabète, de maladie rénale et de maladie coronarienne, et étaient plus susceptibles d’être hospitalisés en raison d’une COVID-19 aiguë. L’ARN du SRAS-CoV-2 était présent chez 28 % des patients PASC négatifs (nombre de copies entre 0,1 et 2,1 copies/ul) et chez 59 % des patients PASC positifs (nombre de copies entre 0,1 et 2,1 copies/ul). 0,1 et 12,7 copies/ul).

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Le SARS-CoV-2 S était présent chez 14 et 21 patients PASC-négatifs et PASC-positifs, respectivement. Parmi les patients PASC-positifs, 33 % (n = 11) des échantillons étaient positifs pour le SARS-CoV-2 S et l’ARN viral, 30 % (n = 10) étaient positifs pour le SARS-CoV-2 S uniquement et 18 % (n =6) pour l’ARN du SRAS-CoV-2 uniquement. Cependant, aucun des patients PASC négatifs n’était positif pour les deux composants viraux. De plus, 53 % (n = 8) des patients PASC positifs ont montré une positivité pour le S associé à l’EV, et les niveaux étaient similaires à ceux trouvés chez les patients atteints de COVID-19 aigu, tandis que les EV parmi les patients PASC négatifs étaient SARS-CoV- 2 S-négatif.

conclusion

Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont démontré la persistance de l’ARN du SRAS-CoV-2 et des fragments S circulants chez les patients atteints de PASC (> 1 an de diagnostic de COVID-19 dans certains cas), indépendamment de leur absence ou de leur présence dans la phase aiguë de COVID- 19. 19 Les résultats ont également montré que le SRAS-CoV-2 S, mais pas l’ARN, était présent dans les SEV du plasma obtenu de patients atteints de COVID-19 aigu ou de COVID prolongé.

*Nouvelles importantes

medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et ne doivent donc pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique ou les comportements liés à la santé, ou être traités comme des informations établies.

Référence magazine :
  • Craddock, V. et al. (2022) « Présence persistante de la protéine Spike et de l’ARN viral dans la circulation des individus présentant des séquelles post-aiguës de COVID-19. » medRxiv. est ce que je: 10.1101/2022.08.07.22278520.

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