Un nouvel algorithme développé par des chercheurs de l’Université de Columbia peut analyser des milliers de variantes dans tout le génome et estimer le risque de développer une maladie rénale chronique, et cela fonctionne chez les personnes d’ascendance africaine, asiatique, européenne et latino.
« Avec cette approche polygénique, nous pouvons identifier les personnes à risque des décennies avant l’apparition de la maladie rénale, et celles à haut risque pourraient adopter des changements de mode de vie protecteurs pour réduire ce risque », déclare Krzysztof Kiryluk, MD, professeur agrégé de médecine et médecin. scientifique de la division de néphrologie du Vagelos College of Physicians and Surgeons de l’Université de Columbia. (Le diabète, l’hypertension artérielle, l’obésité et certains médicaments, tels que les AINS, sont connus pour augmenter le risque de maladie rénale.)
La détection précoce d’une maladie rénale pourrait prévenir de nombreux cas d’insuffisance rénale et réduire le besoin d’une greffe ou d’une dialyse, mais la maladie reste souvent silencieuse jusqu’à ce qu’elle cause des lésions rénales importantes.
Les tests génétiques pourraient offrir un moyen de prédire le risque de maladie rénale d’une personne bien avant l’apparition des symptômes, mais des milliers de variantes héréditaires sont susceptibles d’être impliquées, et la plupart n’ont que de petits effets. Ajoutant à la complexité, certaines variantes génétiques sont plus courantes dans certaines ethnies que dans d’autres.
« Dans la plupart des populations, nous ne pouvons pas simplement examiner une ou deux variantes génétiques et vous dire quel est votre risque. Des milliers de variantes sont susceptibles d’y contribuer. »
Krzysztof Kiryluk, MD, professeur agrégé de médecine et médecin-chercheur dans la division de néphrologie de l’Université Columbia Vagelos College of Physicians and Surgeons
Dans une nouvelle étude publiée en ligne sur Médecine naturelle, Kiryluk et son équipe ont décrit leur méthode et l’ont testée sur 15 groupes de personnes différents, y compris ceux d’origine européenne, africaine, asiatique et latino. L’algorithme recherche des variantes d’un gène appelé APOL1, connu pour être une cause fréquente de maladie rénale chez les personnes d’ascendance africaine, et des milliers d’autres variantes de maladie rénale trouvées chez des personnes de toutes origines.
Parmi tous les ancêtres, les personnes ayant les scores les plus élevés (dans le top 2%) avaient trois fois plus de risque de maladie rénale que la population générale, ce qui équivaut à avoir des antécédents familiaux de maladie rénale.
L’étude a également confirmé que l’APOL1 était un facteur de risque majeur chez les personnes d’ascendance africaine. Mais même lorsque APOL1 est présent chez un individu, d’autres gènes peuvent augmenter ou diminuer le risque de développer une maladie rénale chronique. « Pour les personnes d’ascendance africaine, APOL1 est une partie importante de l’image, mais pas la seule », explique Kiryluk. Ces informations peuvent être importantes lorsque de nouveaux médicaments développés spécifiquement pour les personnes atteintes d’APOL1 deviennent disponibles.
« Les personnes atteintes d’APOL1 mais à faible risque polygénique peuvent ne pas avoir besoin d’interventions spécifiques, car leur risque pourrait être comparable à celui de la population générale », explique Kiryluk. « En revanche, les personnes présentant le risque génétique le plus élevé, celles atteintes d’APOL1 et à risque polygénique élevé, peuvent bénéficier le plus de changements de mode de vie ou d’un traitement médicamenteux. »
D’autres tests de la nouvelle méthode de prédiction sont nécessaires avant de pouvoir l’utiliser en milieu clinique, ajoute Kiryluk.
La méthode est testée dans une vaste étude nationale, appelée eMERGE-IV, qui testera les participants et offrira un suivi supplémentaire et des tests de laboratoire aux personnes à haut risque génétique. L’étude déterminera si les tests génétiques pour le nouveau score de risque affectent les résultats cliniques, y compris les changements de mode de vie et les taux de nouveaux diagnostics de la maladie de Kdiney.
Centre médical Irving de l’Université Columbia
Can, A. et coll. (2022) Score polygénique à l’échelle du génome pour prédire l’insuffisance rénale chronique chez les ancêtres. Médecine de la nature. doi.org/10.1038/s41591-022-01869-1.