Pooja Toshniwal Paharia

Une étude identifie deux nouveaux virus hautement pathogènes de la grippe aviaire (H5N1) du clade 2.3.4.4b.2

Dans une étude récente publiée dans le Emerging Infectious Diseases Journal, les chercheurs ont étudié l’origine génétique, les schémas de distribution et l’antigénicité de deux cygnes migrateurs décédés de Chine infectés par les nouveaux virus de la grippe aviaire (VIA) H5N1.

Étude : Nouveaux assemblages du Clade 2.3.4.4b du virus de la grippe aviaire (H5N1) chez les oiseaux migrateurs, Chine.  Crédit d'image : KaterynaKon / Shutterstock.comÉtude: Nouveaux assemblages du clade 2.3.4.4b du virus de la grippe aviaire (H5N1) chez les oiseaux migrateurs, Chine. Crédit d’image : KaterynaKon / Shutterstock.com

Arrière-plan

Les AIV hautement pathogènes (HPAIV), tels que le H5N1, ont été découverts en 1996, et les espèces de HPAIV de type H5 se sont depuis développées dans des clades génétiques antigéniquement divergents, entraînant des épidémies persistantes chez les oiseaux.

La transmission rapide et à longue distance du HPAIV de type H5 indique que les oiseaux migrateurs sont cruciaux pour la transmission mondiale du HPAIV.

Jusqu’à présent, il y a eu au moins quatre vagues de transmission du virus H5 : le virus H5N1 du clade 2.2 entre 2005 et 2006, le clade H5N1 du virus H5N1 2.3.2.1c entre 2009 et 2010, le clade 2.3.4.4a H5N8 et le clade 2.3.2.1c. virus H5N1 entre 2014 et 2015, et virus 2.3.4.4b clade H5Ny entre 2016 et 2017.

La plus récente flambée épidémique de 2.3.4.4b clade H5N1/H5N8 HPAIV chez les oiseaux sauvages et domestiques en Afrique et en Eurasie a commencé en 2020-2021.

Les infections à H5N1, H5N6 et H5N8 ont été rarement signalées chez l’homme, ce qui souligne le potentiel de transmission zoonotique des VIA H5 hautement pathogènes.

Le HPAIV H5 a été responsable d’au moins neuf foyers parmi des espèces d’oiseaux sauvages en Chine continentale depuis 2021. Les principaux foyers de HPAIV H5N1 chez les oiseaux domestiques se sont produits aux États-Unis (US) et en Europe entre 2021 et 2022.

Lire aussi  Les hôpitaux sont invités à adopter de nouvelles stratégies de prévention du SARM

À propos de l’étude

Dans la présente étude, les chercheurs ont signalé le réarrangement du clade H5N1 2.3.4.4b parmi la population aviaire migratrice chinoise.

Des écouvillons oraux et des échantillons de poumons ont été prélevés sur un chanter mort en Mongolie intérieure, dans le nord de la Chine, et sur un cygne noir mort dans le Zhejiang, dans l’est de la Chine, les 3 et 15 novembre 2021, respectivement.

Les virus ont ensuite été isolés entre des embryons de poulet exempts d’agents pathogènes spécifiques (SPF) et vérifiés par réaction en chaîne par transcriptase inverse-polymérase (RT-PCR).

Le séquençage de Sanger a été effectué et les génomes entiers ont été déposés dans les bases de données de l’Initiative mondiale pour le partage de toutes les données sur la grippe (GISAID) et du NMDC.

L’équipe a reconstruit des arbres d’origine phylogénétique bayésiens résolus dans le temps pour les trois gènes isolés du virus H5N1 sur la base des références du National Center for Biotechnology Information (NCBI) et du GISAID.

De plus, une analyse géographique a été effectuée pour cartographier les coordonnées spatiales. En outre, l’équipe a cartographié les types d’hôtes et les sous-types de neuraminidase (NA) ou d’hémagglutinine (HA) pour déterminer l’ancêtre le plus probable du virus aviaire.

De plus, des tests d’inhibition de l’hémagglutination (HI) ont été effectués pour évaluer Re-11 [H5N6 (A/duck/Guizhou/S4184/2017)]Re-13 [H5N6 (A/duck/Fujian/S1424/2020)]et le Re-14 [H5N8 (A/whooper swan/Shanxi/4–1/2020)] Immunogénicité du vaccin contre les virus H5N1 et HPAIV H5N8, qui ont été détectés en 2020.

Lire aussi  Les scientifiques de l'UM donnent des conseils sur la façon dont les enseignants peuvent protéger les salles de classe du COVID-19

Résultats

En novembre 2021, trois HPAIV H5N1, c’est-à-dire le virus Ws/NC/AK1-O/2021 et le virus Ws/NC/AK2-O/2021, ont été détectés parmi des échantillons de chanteurs morts dans le nord de la Chine, et le virus Bs/EC /74-Lg/2021 du cygne noir décédé de l’est de la Chine.

Les souches H5N1 ont induit de graves altérations histopathologiques chez les espèces d’oiseaux sauvages, caractéristiques des HPAIV, notamment de nombreuses molécules d’acides aminés de type basique au niveau du site de dégradation de l’HA.

Les trois gènes H5N1 HA partageaient le clade 2.3.4.4b.2. L’analyse phylogénétique a montré que les trois nouveaux isolats viraux H5N1 étaient des réarrangements de Ws/2021 (Ws/NC/AK1-O/2021 et Ws/NC/AK2-O/2021) et Bs/2021 (Bs/EC/74-Lg / 2021).

Diverses activités de réassortiment entre HPAIV H5N8 ont produit les virus. Les ancêtres de la plupart des gènes dans les deux réarrangements provenaient d’Ansériformes sauvages et ont probablement été transmis au cours de l’été 2021, à l’exception de gènes tels que le gène M de type Bs/2021, qui pourrait avoir évolué à partir de volailles domestiques.

La quasi-totalité des gènes de neuraminidase des virus H5N1 découverts en Chine continentale entre 1996 et 2018 appartenaient au clade EA-1. Le premier groupe comprenait quatre HPAIV H5N8 découverts parmi des espèces d’oiseaux sauvages en 2020, la souche Re-14, huit virus H5N6 et un virus H5N8 qui a provoqué des infections humaines.

Bs/EC/74-Lg/2021 regroupés avec les virus de la grippe H5N1 provenant de la Corée du Sud et du Japon dans le deuxième groupe, avec des séquences identiques de 99,0 % à 100,0 %.

Dans le troisième groupe, les virus dérivés du cygne chanteur de Chine du Nord ont montré une similarité antigénique de 99,0 % et se sont regroupés avec des souches virales H5N1 d’origine européenne. La plupart des virus H5N1 découverts entre 2020 et 2021 étaient regroupés dans le troisième groupe.

Lire aussi  L'élément transposable contrôle le système immunitaire pour favoriser la survie de l'hôte pendant l'infection virale

De plus, deux infections à H5N1 (troisième groupe) ont été documentées parmi des résidents du Royaume-Uni et des États-Unis entre 2021 et 2022.

L’analyse HA a montré 256 titres d’anticorps entre les antisérums homologues et les antigènes vaccinaux H5 et des titres beaucoup plus faibles (2,0 à 16) pour Re-11 et Re-13 par les virus H5N1/H5N8 contemporains.

En comparaison, les virus H5N8 du premier groupe ont montré des titres d’anticorps modestes (64,0) contre l’antisérum Re-14. Les virus Ws/NC/AK1-O/2021 et Bs/EC/74-Lg/2021 H5N1 des deuxième et troisième groupes, respectivement, présentaient des titres de 32 et 128, respectivement.

conclusion

Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont mis en évidence la détection de trois HPAIV H5N1 parmi les espèces d’oiseaux sauvages à l’automne 2021 en Chine qui se sont réorganisés lors de la transmission à longue distance via les routes migratoires des oiseaux.

La faible similitude antigénique entre les virus H5N1 et H5N8, bien qu’ils proviennent du même clade génétique, souligne les risques élevés d’infections au H5N1 parmi les troupeaux insuffisamment protégés en Chine continentale.

Les résultats ont également mis en évidence la nécessité d’une surveillance coordonnée à l’échelle mondiale du VIA chez les oiseaux migrateurs afin de faciliter la détection précoce et le traitement rapide des infections à VIA..

Référence magazine :
  • J Yang., et al. (2023) « Nouveau virus de la grippe aviaire (H5N1) clade 2.3.4.4b réarrangé chez les oiseaux migrateurs, Chine ». infections émergentes. faire: 10.3201/eid2906.221723.

Laisser un commentaire

Votre adresse e-mail ne sera pas publiée. Les champs obligatoires sont indiqués avec *