Une étude élargit les connaissances sur la diversité virale intestinale chez les nourrissons en bonne santé

Les virus sont généralement associés à la maladie. Mais notre corps regorge de bactéries et de virus qui prolifèrent et interagissent constamment les uns avec les autres dans notre tractus gastro-intestinal. Bien que nous sachions depuis des décennies que les bactéries intestinales chez les jeunes enfants sont essentielles pour les protéger des maladies chroniques plus tard dans la vie, nos connaissances sur les nombreux virus qui s’y trouvent sont minimes.

Il y a quelques années, cela a donné à Dennis Sandris Nielsen, professeur à l’Université de Copenhague, l’idée d’approfondir cette question. Como resultado, un equipo de investigadores de COPSAC (Copenhagen Prospective Studies on Asthma in Childhood) y el Departamento de Ciencias de la Alimentación de la UCPH, entre otros, pasó cinco años estudiando y mapeando el contenido de los pañales de 647 niños daneses sanos de un an.

« Nous avons trouvé un nombre exceptionnel de virus inconnus dans les selles de ces bébés. Non seulement des milliers de nouvelles espèces de virus, mais à notre grande surprise, les virus représentaient plus de 200 familles de virus encore à décrire. Cela signifie que, depuis le début de vie, les enfants en bonne santé sont confrontés à une extrême diversité de virus intestinaux, qui sont susceptibles d’avoir un impact majeur sur le développement de diverses maladies plus tard dans la vie », explique le professeur Dennis Sandris Nielsen du Département des sciences de l’alimentation, auteur principal de l’étude étude. document de recherche sur l’étude, maintenant publié dans microbiologie de la nature.

Les chercheurs ont trouvé et cartographié un total de 10 000 espèces virales dans les matières fécales des enfants, un nombre dix fois supérieur au nombre d’espèces bactériennes chez les mêmes enfants. Ces espèces virales sont réparties dans 248 familles virales différentes, dont seulement 16 étaient connues auparavant. Les chercheurs ont nommé les 232 familles virales inconnues restantes d’après les enfants dont les couches ont rendu l’étude possible. En conséquence, les nouvelles familles virales incluent des noms tels que sylvesterviridae, Rigmorviridés et Tristanviridae.

Les virus bactériens sont nos alliés

C’est la première fois qu’un tel aperçu systématique de la diversité virale intestinale a été compilé. Il fournit une base complètement nouvelle pour découvrir l’importance des virus pour le développement de notre microbiome et de notre système immunitaire. Nous émettons l’hypothèse que parce que le système immunitaire n’a pas encore appris à séparer le bon grain de l’ivraie à l’âge d’un an, une richesse extraordinairement élevée en espèces de virus intestinaux émerge, et est probablement nécessaire pour se protéger contre les maladies chroniques comme l’asthme et le diabète. plus tard. dans la vie ».

Shiraz Shah, premier auteur et chercheur principal COPSAC

Quatre-vingt-dix pour cent des virus trouvés par les chercheurs sont des virus bactériens, appelés bactériophages. Ces virus ont des bactéries comme hôtes et n’attaquent pas les propres cellules des enfants, ce qui signifie qu’ils ne causent pas de maladie. L’hypothèse est que les bactériophages servent principalement d’alliés :

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« Nous partons de l’hypothèse que les bactériophages sont en grande partie responsables de la formation des communautés bactériennes et de leur fonction dans notre système intestinal. Certains bactériophages peuvent apporter à leur bactérie hôte des propriétés qui la rendent plus compétitive en intégrant son propre génome dans le génome de la bactérie. Lorsque cela se produit, un bactériophage peut augmenter la capacité d’une bactérie à absorber, par exemple, divers glucides, permettant à la bactérie de métaboliser plus de choses », explique Dennis Sandris Nielsen, qui poursuit :

« Il semble également que les bactériophages aident à maintenir l’équilibre du microbiome intestinal en contrôlant les populations bactériennes individuelles, garantissant qu’il n’y a pas trop d’espèces bactériennes dans l’écosystème. C’est un peu comme les populations de lions et de gazelles dans la savane. »

Shiraz Shah ajoute :

« Auparavant, la communauté de recherche se concentrait principalement sur le rôle des bactéries en relation avec la santé et la maladie. Mais les virus sont la troisième jambe des selles, et nous devons en savoir plus à leur sujet. Il est très probable que les virus, les bactéries et le système immunitaire interagissent et s’affectent mutuellement dans une sorte d’équilibre. Tout déséquilibre dans cette relation augmente probablement le risque de maladie chronique.

Les dix pour cent restants des virus trouvés chez les enfants sont eucaryotes, c’est-à-dire qu’ils utilisent des cellules humaines comme hôtes. Ceux-ci peuvent être à la fois amis et ennemis pour nous :

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« Cela donne à réfléchir que chaque enfant coure avec 10 à 20 de ces types de virus qui infectent les cellules humaines. Il y a donc une infection virale constante, qui ne semble pas les rendre malades. Nous ne savons que très peu de choses sur ce qui se passe réellement. .  » en jeu. Je suppose qu’ils sont importants pour entraîner notre système immunitaire à reconnaître les infections plus tard. Mais il se peut aussi qu’ils soient un facteur de risque pour des maladies que nous n’avons pas encore découvertes « , déclare Dennis Sandris Nielsen.

Pourrait jouer un rôle important dans les maladies inflammatoires

Les chercheurs n’ont pas encore découvert d’où viennent les nombreux virus chez les enfants d’un an. Votre meilleure réponse jusqu’à présent est l’environnement :

« Notre intestin est stérile jusqu’à notre naissance. Lors de la naissance, nous sommes exposés aux bactéries de la mère et de l’environnement. Il est probable que certains des premiers virus arrivent avec ces bactéries initiales, tandis que de nombreux autres sont introduits plus tard à travers les doigts sales, les animaux domestiques, la saleté que les enfants mettent dans leur bouche et d’autres choses dans l’environnement », explique Dennis Sandris Nielsen.

Comme le souligne Shiraz Shah, l’ensemble du domaine de la recherche traite d’un énorme problème de santé mondial :

« De nombreuses recherches suggèrent que la plupart des maladies chroniques que nous connaissons, de l’arthrite à la dépression, ont une composante inflammatoire. C’est-à-dire que le système immunitaire ne fonctionne pas comme il le devrait, ce qui pourrait être dû au fait qu’il n’était pas travailler. » . Il n’a pas été formé correctement. Par conséquent, si nous en apprenons davantage sur le rôle que jouent les bactéries et les virus dans un système immunitaire bien entraîné, cela nous aidera, espérons-le, à éviter bon nombre des maladies chroniques qui affligent tant de personnes aujourd’hui. »

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Des groupes de recherche ont commencé à étudier le rôle des virus intestinaux par rapport à un certain nombre de maladies différentes qui surviennent dans l’enfance, telles que l’asthme et le TDAH.

Fontaine:

Université de Copenhague – Faculté des sciences

Référence magazine :

Sha, SA, et autres. (2023). Expansion de la diversité virale connue dans l’intestin sain du nourrisson. microbiologie de la nature. doi.org/10.1038/s41564-023-01345-7.

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