Un test génomique développé par une société de Charlottesville, en Virginie, peut prédire le risque d’un patient de développer un COVID-19 sévère, selon une nouvelle recherche d’UVA Health. Ces informations pourraient aider les médecins à identifier les patients à haut risque de mauvais résultats et à démarrer rapidement un traitement personnalisé.
L’approche a démontré une précision supérieure à 90 % dans la prédiction des résultats chez plus de deux douzaines de patients de l’unité de soins intensifs de l’UVA et 100 patients à partir de données accessibles au public générées à Duke et Harvard. Le test, appelé CovGENE, examine les gènes exprimés dans le sang d’une personne pour déterminer si elle peut subir une évolution grave de la maladie avec un risque accru de décès.
Nous avons parcouru un long chemin dans la prévention et le traitement du COVID-19 au cours des deux dernières années. Quoi qu’il en soit, nous avons encore du mal à identifier les patients à risque plus élevé de maladie grave. Notre étude utilise une approche d’analyse génétique pour identifier une signature de cellule immunitaire, distincte d’autres maladies respiratoires, qui est corrélée à de pires résultats. Cette connaissance a le potentiel d’aider à évaluer le profil immunologique des patients avec des tests couramment disponibles pour identifier les patients à risque de mauvais résultats qui bénéficieraient d’une surveillance plus étroite et de thérapies avancées pour faciliter la récupération. »
Alexandra Kadl, MD, chercheuse, division de médecine pulmonaire et de soins intensifs, UVA Health
Prédiction de la gravité du COVID-19
Sur la base des résultats prometteurs de la recherche sur les UVA, le développeur de CovGENE, AMPEL Biosolutions, cherche à s’associer à une société de tests de diagnostic ou à une société pharmaceutique pour commercialiser l’approche sous la forme d’un simple test sanguin basé sur la PCR.
« Cette collaboration unique avec nos collègues de l’Université de Virginie a fourni un moyen simple et novateur d’évaluer la réponse d’un patient au virus SRAS-CoV-2 et de prédire les résultats cliniques », a déclaré Peter Lipsky, MD, PDG d’AMPEL, chef médecin-chef et co-fondateur. « Maintenant que cette approche unique a été validée, nous attendons avec impatience son développement rapide en tant qu’outil de médecine de précision qui peut améliorer les résultats des patients COVID-19 et réduire le nombre d’hospitalisations, en particulier les plus vulnérables. »
AMPEL Biosolutions vise à utiliser les données génomiques pour améliorer la prise en charge des patients. La société développe des tests d’expression génique pour des échantillons de sang ou de tissus afin d’aider les cliniciens à prendre des décisions cliniques.
La co-fondatrice de l’entreprise, Amrie Grammer, PhD, est une ancienne élève de l’UVA et y a obtenu son baccalauréat et sa maîtrise.
résultats publiés
Les chercheurs ont publié leurs découvertes dans la revue Frontières en immunologie. L’équipe était composée d’Andrea R. Daamen, Prathyusha Bachali, Catherine A. Bonham, Lindsay Somerville, Jeffrey M. Sturek, Amrie Grammer, Alexandra Kadl et Peter Lipsky. Daamen, Bachali, Grammer et Lipsky sont des employés d’AMPEL BioSolutions.
Le travail a été soutenu par les National Institutes of Health du National Institute of Heart and Lung Blood, subvention K23 HL143135; l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses, subvention 1R21AI160334 ; l’initiative de réponse rapide COVID-19 de l’UVA Global Institute of Infectious Diseases ; et la Fondation RILITE.
Système de santé de l’Université de Virginie
Daaman, AR, et coll. (2022) Les patients COVID-19 présentent des signatures transcriptionnelles uniques qui indiquent la gravité de la maladie. Frontières en immunologie. doi.org/10.3389/fimmu.2022.989556.