Dr Liji Thomas, MD

Le risque d’asthme chez l’enfant semble être influencé à la fois par le microbiome intestinal et le génotype 17q12-21

L’asthme infantile est une condition qui peut être affectée par différents types de facteurs. Ceux-ci incluent l’état du microbiome intestinal du bébé, les facteurs environnementaux et les facteurs génétiques. Une étude récente a tenté de mieux comprendre comment le risque d’asthme est lié à une combinaison de ces facteurs, dont certains sont modifiables.

Étude : Associations environnementales et génétiques avec une maturation microbienne intestinale anormale dans l'asthme infantile.  Crédit d'image : cheval de Troie/ShutterstockÉtude : Associations environnementales et génétiques avec une maturation microbienne intestinale anormale dans l’asthme infantile. Crédit d’image : cheval de Troie/Shutterstock

Introduction

On sait maintenant que le microbiome intestinal intervient ou contribue à une proportion significative des cas d’atopie. Cela inclut la composition et la maturation du microbiome à la naissance et pendant la petite enfance. Le risque d’atopie a également été lié au locus du gène 7q12-21, associé à des facteurs qui déterminent la composition du microbiome intestinal, comme le fait de grandir dans une ferme ou d’avoir des frères et sœurs plus âgés.

L’identification des facteurs qui déterminent la façon dont le microbiome intestinal mûrit pendant l’enfance est nécessaire pour potentiellement prévenir le développement futur de l’atopie.

Dans la présente étude, publiée dans le Journal d’allergie et d’immunologie clinique, les scientifiques ont examiné des échantillons du microbiome intestinal de plus de 460 nourrissons âgés de 3 à 6 mois et un an. Il s’agissait d’enfants de parents ayant participé à l’essai de réduction prénatale de la vitamine D (VDAART). Ils ont recherché des liens potentiels entre le microbiote intestinal et les facteurs génétiques chez ces bébés et le risque d’asthme à l’âge de trois ans.

Les enquêteurs ont utilisé des échantillons longitudinaux d’ARNr 16s fécaux (acide ribonucléique ribosomal) de ces enfants, prélevés à 3-6 mois, 1 an ou les deux. Ils ont également examiné la présence de génotypes 17q12-21 de type sauvage ou mutationnels en association avec le risque d’asthme et la maturation microbienne dans la cohorte précédente et les études prospectives de Copenhague de 2010 sur l’asthme infantile (COPSAC). Ces cohortes se distinguent par le fait que la mère biologique de la cohorte précédente était atopique ou asthmatique.

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L’enfant devait être diagnostiqué avec de l’asthme ou une respiration sifflante récurrente à ce moment par un médecin pour être éligible à cette étude. L’étude a également exploré les contributions des différences entre les sexes bifidobactéries et Bacteroidesqui ont été signalés comme étant liés au mode d’accouchement et à la lactation.

Que montre l’étude ?

Les enfants les plus susceptibles d’avoir de l’asthme étaient moins susceptibles d’être dans le bras de l’étude de San Diego, d’avoir des chiens de compagnie ou d’être allaités, et plus susceptibles d’être noirs et d’avoir reçu des antibiotiques au moment de l’accouchement par rapport aux enfants non asthmatiques (53 % contre 39 %, respectivement).

Les résultats de cette étude montrent que les enfants à risque accru d’asthme infantile à trois ans étaient plus susceptibles de présenter une maturation rapide du microbiome fécal à 3-6 mois ou une maturation retardée du microbiome fécal à un an.

augmenté et diminué bifidobactéries l’abondance à 3-6 mois était liée à l’allaitement et à une plus grande maturité microbienne. Cela confirme l’observation de cette étude selon laquelle les nourrissons allaités présentent un retard de maturation microbienne à ce moment.

De la même manière, Bacteroides l’abondance à 3-6 mois était associée à l’allaitement et la plus faible abondance à la césarienne aux deux moments. Bacteroides par conséquent, l’abondance était associée à une maturation plus rapide du microbiome intestinal à l’âge de 1 an.

Les enfants asthmatiques à l’âge de trois ans étaient 70 % moins susceptibles d’avoir eu Bacteroides dans leurs échantillons fécaux à 3-6 mois et >30% moins probable à 1 an. Ils étaient également plus susceptibles d’avoir un faible Bacteroides abondance à 3-6 mois que ceux sans asthme.

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Une maturation lente à 3-6 mois était plus probable chez les nourrissons allaités. Plus de 60% de l’association du risque d’asthme avec l’allaitement maternel s’est avérée être due à l’association de ce dernier avec une maturation microbienne améliorée à 3-6 mois.

Les bébés nés par césarienne plutôt que par voie vaginale étaient plus susceptibles de présenter un retard de maturation du microbiome à un an, mais pas plus tôt. Ces résultats semblent renforcer le rôle favorable de l’allaitement et de l’accouchement vaginal dans la réduction du risque d’asthme.

L’exposition aux antibiotiques et la possession d’un animal domestique n’étaient pas significativement liées à la maturation microbienne. Les effets environnementaux médiés par la maturation du microbiome fécal se sont avérés agir indépendamment des facteurs génétiques, mais en plus de ceux-ci.

Les allèles à risque 17q12-21 rs12936231 et rs8076131 présentaient un risque accru d’asthme de 30 % et 25 % lorsqu’ils étaient ajustés en fonction de la race et de l’origine ethnique.

Lorsque les deux allèles étaient présents avec une maturation microbienne accrue à 3-6 mois, le risque d’asthme infantile a plus que triplé. À cet âge, la moitié des sujets ayant au moins un allèle à risque au niveau de rs12936231 et une maturation accélérée ont développé de l’asthme, mais seulement 6 % sans l’un ou l’autre de ces facteurs ont présenté un risque presque 20 fois plus élevé. Le risque était multiplié par 6,5 si un allèle de risque rs8076131 était présent avec une maturation aberrante par rapport à l’absence de facteurs de risque.

Si seuls le microbiome ou les facteurs génétiques étaient présents, le risque était respectivement de six et 3,5 fois, par rapport à l’absence de facteur de risque. Ces modèles ont été répétés pendant un an. L’ordre de risque accru est de l’absence de risque génétique ou de microbiome

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Quelles sont les implications ?

Les résultats de cette étude montrent qu’une maturation anormale du microbiome intestinal chez les nourrissons est responsable de l’association connue de l’asthme avec des facteurs environnementaux tels que l’allaitement. De plus, la cohorte VDAAR comprenait des mères atteintes d’atopie ou d’asthme, ce qui provoque l’empreinte du système immunitaire fœtal sans altération génétique réelle.

« Les bébés qui développent de l’asthme sont plus susceptibles de s’écarter du développement normal du microbiome au cours de la première année de vie, et ces différences de maturation microbienne peuvent être affectées par des expositions modifiables, telles que l’allaitement. »

Les expositions environnementales semblent affecter la maturation du microbiome du nourrisson, modulant le risque d’asthme. Les facteurs affectant la maturation microbienne comprenaient l’allaitement et le mode d’accouchement, et la maturation elle-même était indiquée par les abondances différentielles de deux espèces clés, Bacteroides et bifidobactéries.

Cependant, les facteurs génétiques, notamment la nature des gènes au locus 17q12-21, montrent un effet additif qui agit indépendamment des facteurs environnementaux. Cela contredit certaines études antérieures, qui mettent en évidence les interrelations complexes de ces facteurs de risque. Des études plus importantes avec des examens plus approfondis et fréquents du microbiome aideront à mieux expliquer ces relations.

Référence magazine :
  • Chen, Y. et al. (2023). Associations environnementales et génétiques avec une maturation microbienne intestinale aberrante au début de la vie dans l’asthme infantile. Journal d’allergie et d’immunologie clinique. est ce que je:

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