Une nouvelle méthode aide à identifier les microbes intestinaux les plus susceptibles de contribuer aux maladies inflammatoires

Les chercheurs de Cedars-Sinai ont développé une méthode pour aider à identifier les microbes intestinaux humains les plus susceptibles de contribuer à une multitude de maladies inflammatoires telles que l’obésité, les maladies du foie, les maladies inflammatoires de l’intestin, le cancer et certaines maladies neurologiques.

La technique, décrite dans la revue à comité de lecture Science Médecine translationnelleutilise une protéine présente dans le sang qui détecte les microbes intestinaux qui ont traversé la barrière intestinale et activé les cellules immunitaires dans tout le corps ; un développement qui pourrait conduire à de nouveaux traitements ciblant les microbes inflammatoires de l’intestin.

« Les microbes qui traversent la barrière intestinale provoquent généralement une inflammation et une activation du système immunitaire, qui sont des caractéristiques clés de nombreuses maladies inflammatoires », a déclaré Ivan Vujkovic-Cvijin, PhD, professeur adjoint au Département des sciences biomédicales et de gastroentérologie de Cedars-Sinai. et auteur principal de l’étude. « En comprenant quels microbes spécifiques traversent l’intestin et provoquent une inflammation dans une maladie, nous pouvons concevoir des méthodes pour se débarrasser de ces microbes et arrêter la maladie. »

Alors que l’on pense que le microbiome intestinal joue un rôle important dans les maladies causées par une suractivation immunitaire, bon nombre de ces maladies impliquent des organes au-delà de l’intestin. Actuellement, il existe des outils limités pour identifier les microbes intestinaux qui ont traversé la barrière intestinale et activé les cellules immunitaires en dehors du tractus gastro-intestinal.

Pour concevoir une méthode plus précise, des chercheurs de Cedars-Sinai et de l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses ont utilisé du sérum humain, le liquide présent dans le sang qui contient tous les anticorps d’un individu, pour quantifier les réponses immunitaires contre les microbes intestinaux.

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L’utilisation de sérum humain permet aux chercheurs de comprendre les réponses immunitaires du corps entier à tous les microbes intestinaux, aidant ainsi les chercheurs à mieux comprendre si des microbes spécifiques provoquent une activation immunitaire dans ces maladies.

L’équipe a utilisé un séquençage à haut débit pour calculer un score IgG, qui est utilisé pour mesurer le nombre d’anticorps contre chaque microbe intestinal.

Les bactéries peuvent migrer de l’intestin vers d’autres tissus avec des effets pléiotropes que nous ne comprenons pas encore complètement. Par conséquent, nous avons besoin de nouvelles façons d’évaluer la translocation de manière non invasive. »

Suzanne Devkota, PhD, professeur agrégé à la division de gastroentérologie de Cedars-Sinai et co-auteur de l’étude

En appliquant cette technique aux maladies inflammatoires de l’intestin, les chercheurs ont découvert plusieurs bactéries ciblées par le système immunitaire par rapport aux témoins sains. Cela comprenait diverses bactéries intestinales dans le Collinsella, Bifidobacterium, Lachnospiracées Oui Ruminococcaceae.

« Beaucoup de bactéries que nous avons identifiées n’ont pas été considérées comme des causes possibles de cette maladie », a déclaré Vujkovic-Cvijin. « Cette activité microbienne est probablement pertinente pour la progression de la maladie et peut représenter une cible thérapeutique viable. »

L’équipe prévoit de continuer à suivre les observations de l’étude pour en savoir plus sur les mécanismes des bactéries intestinales spécifiques identifiées comme cibles potentielles.

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Centre médical Cedars-Sinai

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