Une nouvelle technologie peut analyser rapidement l’état métabolique des lipides dans les cellules

Le professeur Itaru Hamachi, le professeur Tomonori Tamura et le professeur adjoint Masaki Tsuchiya de l’université de Kyoto ont mis au point une nouvelle technologie appelée O-ClickFC (marquage de clic sélectif d’organelle avec cytométrie en flux), qui peut, à très grande vitesse, analyser l’état métabolique de lipides dans les cellules.

L’analyse classique des lipides cellulaires implique principalement l’analyse radiométrique et la spectrométrie de masse d’extraits cellulaires collectés en grande quantité. Cette méthode est longue et fastidieuse et fastidieuse lors de l’analyse d’un grand nombre d’échantillons. Le problème doit être abordé pour élucider la relation entre 20 000 types de gènes humains et le métabolisme des lipides.

Dans cette étude, les chercheurs ont développé O-ClickFC, une technologie qui convertit l’abondance et la distribution spatiale des lipides dans les cellules vivantes en une simple information de signal fluorescent et l’analyse à une vitesse ultra-rapide (10 000 cellules par seconde). Ceci est fait en utilisant une réaction de clic unique. qui peut marquer les lipides avec des colorants fluorescents dans les cellules vivantes. En combinant cette technologie avec «l’édition du génome», il est possible de sélectionner des cellules présentant un métabolisme lipidique anormal à partir d’une population cellulaire présentant des mutations dans tous les gènes humains et d’identifier les gènes responsables. À titre d’expérience de démonstration, le groupe de recherche a identifié 49 gènes importants pour le métabolisme de la phosphatidylcholine (PC), un composant majeur des lipides humains, et a découvert de nombreux nouveaux gènes, dont FLVCR1, dans le processus. D’après une analyse approfondie, FLVCR1 s’est avéré jouer un rôle dans l’absorption de choline, un nutriment essentiel pour les fonctions corporelles normales et la santé humaine. En outre, les chercheurs ont élucidé une partie du mécanisme de la pathogenèse du mutant FLVCR1, qui provoque une maladie neurologique héréditaire et une perte d’absorption de la choline.

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Il est devenu évident au fil des années que les anomalies métaboliques sont à l’origine de maladies telles que le cancer, l’obésité et le diabète. Par conséquent, O-ClickFC peut être appliqué pour l’analyse non seulement des lipides mais également de divers métabolites tels que les sucres et les acides aminés pour identifier les facteurs génétiques liant la pathogenèse et les anomalies métaboliques, ainsi que la découverte de molécules candidates comme cibles thérapeutiques. .

Fontaine:

Agence japonaise pour la science et la technologie (JST)

Référence magazine :

Tsuchiya, M. et autres. (2023). Le marquage sélectif par clic des organites associé à la cytométrie en flux permet un dépistage combiné CRISPR des gènes impliqués dans le métabolisme de la phosphatidylcholine. Métabolisme cellulaire. doi.org/10.1016/j.cmet.2023.02.014.

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